江苏省林业生态工程重点实验室依托南京林业大学生态学国家级重点学科和森林培育省级重点学科，主要由森林生态、水土保持、环境科学、森林培育等骨干实验室组成。1995年被批准为原林业部重点开放实验室，2005年被江苏省教育厅批准为省高校重点实验室。现有固定研究人员49人，其中教授20人，副教授14人，讲师8人，管理人员7人。90%以上教授、副教授均具有博士学位。建设期间，分别从美国、加拿大、日本等国家的著名大学引进了取得博士学位人员9人。目前实验室面积3500多平方米，拥有下蜀城市森林生态系统定位研究站1个，实验用地面积近70公顷。拥有等离子发射光谱仪(ICP)、气相色谱仪、Li-8100土壤呼吸系统、Li-6400光合作用仪、元素分析仪等大型仪器60余台，价值2000多万元。实验室主要研究方向包括城市森林生态系统结构与功能、人工林可持续经营理论与技术、丘陵山地植被恢复工程、沿海防护林体系构建技术、湿地生物多样性保护等。

2005年以来，实验室科研团队先后主持和承担了国家和省部级各类科研项目60余项，其中：国家重点基础研究发展计划项目(973)课题1项，国家高新技术及产业化项目(863)专题1项，“十一五”国家科技支撑计划课题或专题11项；国家自然科学基金项目21项，国外先进技术引进项目(948)10项，国家林业局行业公益性科技项目8项，江苏省农业“三项工程”项目5项，省自然科学基金和攻关项目8项，国际合作科研项目2项，总科研经费3000多万元。获国家科技进步二等奖2项，省部级科技奖励一等奖2项，二等奖4项，三等奖1项，各类鉴定与验收成果12项。出版教材和专著22部，发表学术论文270多篇，其中被SCI、EI收录24篇。